Варп-портал - это точка в космосе, в которой реальность и варп пересекаются, образуя стабильный вход и выход из варп-пространства. Для входа в варп таким способом, нет необходимости активировать варп-двигатели, хотя маловероятно, что судно, не оборудованное варп-щитами, долго проживет в эмпиреях. Этот портал не ведет в туннель, и судно, вошедшее в него, отдается на волю течений варп-пространства. При помощи аккуратного маневрирования можно вернуться в обычный космос, используя такой же портал с обратной стороны. Кроме того, истинная природа порталов также не познана, и никто не знает - возникли ли они по воле случая или имеют некое тайное назначение. Некоторые ксеносы используют варп-порталы, чтобы перемещаться между варпом и реальным миром: особенно это любят существа известные как "поработители", которые сами живут в варпе. Подобно варп-вратам, порталы встречаются везде, и могут находиться на поверхности планет. Некоторые имеют четко выраженную физическую составляющую, тогда как другие невидимы или имеют форму дыры в земле или входа в темную пещеру.
У варп-порталов есть свои клиенты: для уже описывавшихся здесь космических кораблей с поврежденными варп-двигателями, попавших в ловушку в варпе и обреченных на гибель, неожиданное обнаружение варп-портала может позволить им вернуться в реальный мир.